Lorsque vous créez votre personnage principal, à savoir le commandant Shepard, il vous est possible de customiser votre visage mais aussi de choisir la classe et le sexe de votre personnage.
Si vous choisissez d’incarner un héros féminin, les éventuelles relations amoureuses ne seront évidemment pas les mêmes, ce qui aboutira à une variation du scénario.

Tout comme dans un Fall Out ou un Star Wars Kotor vous contrôlerez votre personnage à la troisième personne et lorsqu’un combat débute, un léger zoom s’opère, vous faisant ainsi passer en vue semi 1^ère personne, semi 3^ème personne.

Dans Mass Effect, le gamelay s’appuie sur trois modes de jeu : les phases de combats, les explorations et les conversations. A la manière d’un Star Wars Kotor vous serez accompagné dans votre quête par deux personnages, que vous ne contrôlerez que partiellement (Attaquer ennemi, se mettre à couvert…), préalablement choisis parmi vos compagnons d’aventure.
Par contre vous aurez bien évidemment le contrôle total du personnage principal, le commandant Shepard.

Vous incarnez le commandant Shepard, un homme (ou une femme, au choix) de caractère et expérimenté, envoyé en mission sur Eden Prime afin de retrouver le vil Saren et de révéler aux yeux du monde ces mauvaises intentions.
Saren n’est autre que votre pire ennemi.
Ce dernier à la tête de son puissant vaisseau nommé le Sovereign, est en fuite. Vous devez donc l’intercepter à l’aide de votre équipage et de votre vaisseau légendaire, le Normandy, aussi connu pour être le plus puissant navire spatial de l’armée humaine.
Chaque choix dans Mass Effect aura un impact sur le scénario, à vous de prendre les bonnes décisions au bon moment…