Nous sommes en 2183, l’humanité s’est étendue dans l’univers grâce à sa maîtrise des voyages interstellaires lui permettant de dépasser la vitesse de la lumière. Elle est entrée en contact avec de nombreuses races extra terrestres et tente à présent de se faire une place de choix au sein du vaste échiquier galactique.
Vous incarnez le commander (capitaine de frégate) Shepard, officier des forces armées spéciales de la l’Alliance Interstellaire. Cette coalition est la seule et unique ligne de défense de l’humanité face aux différentes menaces venues de l’espace. Votre mission est d’empêcher l’ouverture d’un portail dimensionnel qui s’ouvre tous les 50 000 ans. Or la légende parle d’une race extra terrestre mécanique qui userait de ce passage entre deux mondes pour venir terrasser et annihiler toutes les races organiques existantes dans l’univers une fois tous les 50 000 ans.
Afin d’éviter ce grand nettoyage destructeur vous devrez traquer puis retrouver votre pire ennemi nommé Saren, qui semble impliqué dans cette sombre histoire de Vortex Inter-dimensionnel d’après les informations qui vous ont été transmises…